南通市生態環境監測站原名南通市通州生態環境監測站，始建於1983年，是從事環境監測和科研的公益性事業單位。該機構以改善生態環境品質為中心，以“科學、嚴謹、公正、高效”的品質方針為目標，對轄區內生態環境品質、污染源監督、機動車尾氣、環境應急、核與輻射環境等多個領域開展監測，為環境管理和決策提供技術支援。