博爾塔拉蒙古自治州環境監測站承擔國控、區控重點污染源監督性監測；重點工業區特徵污染物專項監測；地表水、城市飲用水、沙塵、酸雨、生態環境品質等例行監測；重大、一般性污染事故應急監測；負責編制各類環境監測報告和環境品質公報等。

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