在第二次全國污染源普查工作辦公室的大力推動下，各地按照國務院通知和全國環保工作會議要求，積極推進地方普查機構建立。截至2017年6月底，遼寧、福建、寧夏、安徽、青海、廣東、浙江、甘肅、江西、河南、西藏、河北、海南、上海、新疆、山西、四川等17個省（區、市）陸續成立了第二次全國污染源普查領導小組。福建、吉林、寧夏、青海、甘肅、湖南、江西、陜西、遼寧、廣西、山西、湖北等12個省（區、市）先後成立了第二次全國污染源普查工作辦公室，明確專人專崗。其他地區目前仍在籌備中。