（一）主要職責

　　負責核燃料迴圈設施、放射性廢物處理、貯存和處置設施、核設施退役項目、核技術利用項目、放射性物質運輸的核安全、輻射安全和環境保護的行政許可和監督檢查。負責電磁輻射裝置和設施、鈾（釷）礦、放射性污染治理的環境保護的行政許可和監督檢查。負責伴生放射性礦輻射環境保護的行政許可和監督檢查。負責組織相關核設施、輻射源和放射性物品運輸事件與事故的調查處理。承擔相關國際公約國內履約工作。

　　（二）內設機構

　　根據上述職責，內設5個機構。

　　1.綜合處。承擔司內文電等綜合性事務和綜合協調工作。

　　2.核燃料與運輸處（簡稱核燃料處）。承擔核燃料迴圈設施、放射性物質運輸的核安全、輻射安全和環境保護的行政許可和監督檢查，承擔相關事件與事故的調查處理。

　　3.放射性廢物管理處（簡稱放廢處）。承擔放射性廢物處理、貯存和處置設施、核設施退役項目的核安全、輻射安全和環境保護的行政許可和監督檢查，承擔放射性污染治理的行政許可和監督檢查，承擔相關事件與事故的調查處理。

　　4.核技術利用處（簡稱核技術處）。承擔核技術利用項目的輻射安全和環境保護的行政許可和監督檢查，承擔相關事件與事故的調查處理。

　　5.電磁輻射與礦冶處（簡稱電磁礦冶處）。承擔電磁輻射裝置和設施、鈾（釷）礦項目環境保護的行政許可和監督檢查，承擔伴生放射性礦輻射環境保護的行政許可和監督檢查，承擔相關事件與事故的調查處理。